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东方肝胆医院杨远教授:整体特异性95.7%,敏感度89%,多维度基因组信息助力肝癌早筛

作者:焦艳丽 2021-07-23 14:09

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2021年7月10日,吉因加基因研究院联合苏州生物医药产业园(BioBAY)共同举办第五届肿瘤基因大数据年会。本次会议云集中国工程院程书钧院士、中国科学院杨焕明院士等近300位多位全球顶尖学者,以“多组学·新G遇”为主题,探讨多组学技术带来的新格局,以及基因大数据衍生的无限新机遇。


在10日下午的新应用论坛上,第二军医大学东方肝胆医院杨远教授以《ForeSee肝癌早筛项目研究进展》为题,介绍了中国肝癌早筛现状以及ForeSee肝癌早筛项目最新进展。动脉网对其精彩观点进行了整编。


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杨远教授是第二军医大学东方肝胆医院副主任医师、副教授、医学博士、硕士生导师,临床研究院肝脏组织样本库负责人,中国生物医药技术协会慢病管理分会常务委员、生物样本库分会委员。杨远教授研究方向为原发性肝癌的临床诊治及大样本分子流行病学研究,主持及参与临床基础研究课题15项,发表论文75篇,参编专著3部,获软件著作权9项,申请发明专利4项。


肝癌诊疗现状不容乐观,液体活检成早筛新方向


中国是肝癌发病率最高的国家。世界卫生组织国际癌症研究机构(IARC)发布的2020年全球最新癌症负担数据显示,中国肝癌发病率约占所有癌症发病率的9%,位列第五位。


“作为医生,我们注意到临床上存在一个非常残酷的现象。就是我们收进医院进行手术治疗的肝癌早期患者仅占我们在门诊看到的肝癌患者的20%左右。出现这种现象的原因是因为在早期预防、早期筛查环节存在大量的缺陷等待弥补。”杨远教授表示。


我国原发性肝癌治疗现状不容乐观,一项临床多中心研究显示,1年至5年整体生存率仅有19.6%,远低于世界上肝脏外科治疗整体水平。早期预防、早期筛查、早期治疗是降低肝癌发病率和死亡率最有效的手段之一。数据显示,如果肝癌能够早发现、早治疗,肝癌0期到A期患者的5年生存率能够达到85%-90%。


目前,肝癌早筛技术包括甲胎蛋白、B超、CT、MRI等。其中,甲胎蛋白结合B超能够发现绝大多数的肝癌,是现阶段临床肝癌早筛主流手段。液体活检作为备受瞩目的新兴肝癌早筛技术,国外已有不少研究机构针对cfDNA检测、甲基化、DNA片段化特征等液体活检技术在癌症早筛中的潜力开展了大量研究。


基因变异+HBV整合+cfDNA片段特征,显著提升肝癌早筛性能


近年来,杨远教授团队联合吉因加研发团队基于基因变异、HBV(乙肝病毒)整合、cfDNA片段特征开发肝癌早筛技术。


杨远教授表示,基因变异、HBV整合、cfDNA片段特征等肝癌恶性转化过程中多维度基因组信息,可作为肝癌早筛研究方向。


基因变异方面,肝硬化发展至肝细胞癌的过程中,伴随一系列基因组事件,致癌/抑癌基因变异能使异常增生细胞获得增殖侵袭性和生存优势,在原发性肝癌恶性转化中起到重要作用。


HBV整合方面,大多数HBV相关原发性肝癌中存在病毒-宿主嵌合DNA,且在肝癌中存在热点整合事件如TERT,ctDNA中的嵌合DNA片段被认为是HCC的一个潜在标记物。


cfDNA片段特征方面,研究发现肝癌细胞凋亡断裂的DNA片段比健康人/肝硬化队列cfDNA更短,插入片段差异可用于肝癌早筛,同时基因转录起始位点(TSS)周围,高/低表达基因在核小体结合位点分布上存在差别,肝癌/健康队列核小体分布可用于肝癌早筛。


针对基因变异、HBV整合、cfDNA片段特征应用于肝癌早筛中的前景,杨远教授团队联合吉因加开发了ForeSee肝癌早筛技术,通过20ml血液一次性分析评估293个基因突变、病毒整合及cfDNA片段特征,实现肝癌精准早筛。


据杨远教授介绍,ForeSee肝癌早筛项目队列目前共入组了1158例人群,其中回顾性研究371例,前瞻性队列732例。


回顾性研究显示,ForeSee技术整体特异性高达95.7%,敏感度为89%。同时,将ForeSee技术与甲胎蛋白进行对比,发现在肝细胞癌中,ForeSee技术在0-A期、B期、C期肝细胞癌中的性能表现均优于甲胎蛋白。


前瞻性队列中,ForeSee技术也显示出了较好的性能,敏感性100%,特异性86.7% “但目前我们随访时间较短,只随访了半年左右,希望在后续的随访中,我们能够发现更多的信息。也希望能够有更多中心参与到这个项目中来。”杨远教授谈到。


现在,ForeSee技术前瞻性队列扩大研究正在评估中,未来该技术有望大规模应用于肝癌早期筛查。

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