专为基因组分析打造的NVIDIA CLARA PARABRICKS PIPELINES

是针对由测序器生成的 FASTQ 文件，还是变体识别文件 (VCF)，NVIDIA Clara Parabricks Pipelines 均可将二级分析的速度提高至 30 到 60 倍。此外，Clara Parabricks Pipelines 可在显著提高吞吐量的同时，取得与使用常见二级分析工具（如 GATK4 和 DeepVariant）相当的结果。

Clara Parabricks Pipelines 使用图形处理单元 (GPU) 来加速二级分析。如果使用搭载32-vCPU 的机器来运行当前的分析，则需花费近 30 小时的计算时间。Clara Parabricks Pipelines 则可加速这些计算，能够运用与 GATK4 所用相同的算法，同时使用 8 块 NVIDIA A100 GPU 在 20 分钟内完成分析。Clara Parabricks Pipelines 可以运行所有的 GATK4最佳实践，而且完全可配置。因此，您可以选择要运行的步骤以及流程版本。

通过使用 GPU 加速计算，Clara Parabricks Pipelines 可在一台GPU 服务器上提供与近 40 到 50 个 CPU 服务器相当的吞吐量，从而减少 IT 管理费用和运营成本（包括电力和散热）。无论是分析还是重新分析 NGS 数据，Clara Parabricks Pipelines 都在迅速发展为一款优选解决方案，不仅可为当前流程大幅提升效率，同时还支持由用户主导的定制方案。对于云端用户来说，计算成本与执行时间成正比。Parabricks能够将运行时间缩短到 1/30 至 1/60，与仅使用 CPU 的解决方案相比，最多可将总计算成本降低50%。

在经过比对、排序、标记重复序列和应用 BQSR 阶段之后，此解决方案可输出与基准相同的 BAM 文件。基准变体识别软件具有非确定性，生成的结果可能会因特定参数略有不同。在该步骤内，此软件生成的结果与基准执行结果的相似程度为99.999%。

了解更多NVIDIA医疗健康与生命科学解决方案，欢迎点击专题Pro页面。