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海普洛斯:开启万人基因测序 打造ctDNA核心技术

作者: 约瀚 2015-10-28 08:18

让每一个生命健康120是海普洛斯的愿景,也是他们努力奋斗的方向。

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万人基因测序计划 全国顶级肿瘤医院陆续加盟

2015年7月17日,深圳市海普洛斯生物科技有限公司联合深圳市人民医院,发起了“万人癌症基因测序计划”,通过基因测序,帮助癌症高危人群、癌症患者进行无创早期肿瘤检测、个性化用药指导、耐药评估,其目标是建立属于中国人自己的癌症基因数据库,为中国的癌症精准医疗奠定基础。

该计划通过筛选入组的方式,针对高危人群和癌症患者,实行免费检测。目前,海普洛斯已完成近千例肿瘤样本的基因测序工作。据CEO许明炎介绍,该基因测序计划将在2016年底完成万例肿瘤基因检测,并建立一个关于肿瘤、基因、药物、疗效、临床信息,涵盖正常人群、高危人群、以及癌症患者的数据库。这个数据库将成为国内提供癌症精准诊疗服务的重要基础。

目前,全国已经有数十家大型三甲肿瘤医院加盟该计划。

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海普洛斯CEO许明炎认为,对于癌症的超早期筛查及预防,目前只能给出发病的风险系数,给受试者提供建议。数据库越大越完善,预测的结果才能越准确可靠。目前比较准确的就是对于易感基因的检测。只有做好病人、高危人群、正常人群的疾病、基因、药物、预后等多维度的数据库积累,疾病的超早期筛查和预防才能更加准确可靠。

二代测序(NGS)技术研究经历 成为创业的技术驱动力

“之所以选择肿瘤基因测序作为第一次的创业项目,主要是有两个原因”海普洛斯CEO许明炎说道。

第一,肿瘤的诊疗目前存在非常严重的问题,急需技术变革。在早期检测、个性化用药、预后监测、耐药评估上,目前的诊疗技术存在很大缺陷,急需更先进的技术。在应用类型上,NGS(第二代基因测序技术)市场可划分为肿瘤检测、遗传筛查、传染病研究、药物和生物标志物发现、分子流行病学、农业和其他方面的应用。其中肿瘤检测在收益和样本容量上占据了35%的市场份额,是最容易走向市场的。有关机构预测,中国肿瘤基因测序市场将达到每年200亿元,而且将以15%的年复合率保持增长。

另外,虽然肿瘤基因检测临床应用大幕已开启,但全国的基因测序应用于肿瘤领域还没有任何一个成熟的产品,各方都在蓄势待发。海普洛斯的这一市场选择,机遇与挑战并存。肿瘤领域,尤其是液体样本活检和二代测序的组合,已经成为最有前景的肿瘤精准医疗的手段,但要达到成熟应用于临床,还需要非常多的研发投入。“在这个过程中,所有的测序公司会出现差异化,只有那些拥有核心技术核心竞争力的公司,能够不断研发不断技术革新的公司,才能在未来的竞争中会处于优势地位。”许明炎如此判断。

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第二,这个方向和创始人经历密切相关。许明炎硕士是在北京师范大学读的放射性药物化学,之后在美国攻读生物医学博士学位,主攻测序技术以及测序仪的研发。毕业后在旧金山科技创业公司Cambrian Genomics,负责测序技术和测序仪的开发。在旧金山的工作经历,让他看到了硅谷创业的氛围和激情,也让他看到国内基因测序的发展的光明前景。

在美国攻读博士期间,许明炎大量的接触了二代测序(NGS)技术,他在他导师(Jeremy S. Edwards)的基因测序实验室,和哈佛大学George M. Church实验团队合作完成了一系列基因检测技术和二代测序仪的研发工作,这使得许明炎对基因测序技术有了更深刻的认识和了解。

在旧金山从事基因工作的一年多时间当中,他深深感受到周围创业氛围的冲击,加之自身对测序技术行业未来发展的判断,在2014年,他和他的太太放弃了刚刚拿到的H1B(高科技人员工作签证),带着不到10万美金毅然回国与他高中同学陈实富和方文,在深圳创办了海普洛斯生物科技有限公司,投身于当下的创业浪潮中。

 基因测序 ctDNA核心技术是关键

据许明炎介绍,目前,国内基因测序市场处于一个新兴行业的初级阶段。行业刚刚开始,参与者数量剧增。具体可以分为以下几个类型:

1、带有“基因”、“基因检测”概念的公司可能超过200家,包括销售性质的、包括非测序技术的(FISH、qPCR、DNA芯片等);

2、有基因测序背景及研发能力的公司约在20家以内;

3、针对于更新难度更大的ctDNA测序领域,在国内应该不会超过5家,国外也在同样数目水平。简单来说,以前的非基因测序技术,都是针对一个桌面上30亿个点中的几个点,十几个点,几百个,几百万个点进行鉴定,而基因测序技术可以在非常低成本高效的情况下,一次性把整个面的30亿个点全部扫描鉴定。ctDNA即循环肿瘤DNA,来自于进入血液的死亡的癌细胞,所以在血液中的含量非常低,一般在0.1%-1%的范围内。这么低的含量,用普通的二代测序技术无法完成(检测极限1%以上)。用其他的非测序技术也几乎不太可能探测到这么低的含量,而且越早期含量越低。不能做到超微量,就几乎无法做很多类癌症的预期和筛查。

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基因测序领域是一个爆发的新领域,在未来2-3年,还会有很多新的公司出来。目前行业局势还未明朗。基因测序的临床产品目前只有无创产检(NIPT)一种,然而,一个新的领域,产品最终会成千上万。目前基因测序领域相当于90年代的互联网行业,所以,未来5-10年内,基因测序领域会出现很多新的公司,这些测序公司将会像其他行业一样,分出第一梯队和后续梯队。真正要在第一梯队立足,基于生物医药领域的性质,核心的技术和优秀的产品是充要条件。

文/王约翰

文章标签 基因生物技术
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